蛋白石是天然的含水二氧化硅，含5-10%的水分。内部具球粒结构，集合体多呈葡萄状、钟乳状。底色呈黑色、乳白色、浅黄色、桔红色等。半透明至微透明。玻璃光泽、珍珠光泽、蛋白光泽。具变彩效应。性脆，易干裂，贝壳状断口。在长波紫外线照射下，不同种类的蛋白石发出不同颜色的荧光。
蛋白石分贵蛋白和普通蛋白。贵蛋白在宝石学上称欧泊石，具有变彩效果；变彩效果越强烈，就越珍贵。普通蛋白石不产生变彩效果，但置入水中，光彩柔和，色彩艳丽，过度色均匀，质地细腻，极少数还构成图象，极富美感，因此，深受广大收藏者的喜爱。
雨花石中蛋白石，多为普通蛋白石。
玉髓主要成分为SiO2，可能含有 Fe 、 Al 、 Ti 、 Mn 、 V 等元素。玉髓微透明，呈乳白色。如含有色素离子，就会出现各种颜色，比如：红色玉髓、蓝色玉髓、黑色玉髓、褐色玉髓、深绿色玉髓等等。玉髓的硬度6.5左右，密度2.58~2.64，折射率1.53~1.54。半透明至微透明，玻璃光泽至油脂光泽，韧性较好，几乎可见各种颜色。
玉髓是自然界最常见的玉石品种，也是人类历史上最古老的玉石品种之一。
水晶是一种无色透明的大型石英结晶体矿物。它的主要化学成份是SiO2，二氧化硅结晶完美时就成为水晶 了。水晶中如果含有杂质，如铁、锰、锑等金属离子和自由硅，就会呈现出不同的颜色。水晶按颜色分类，有：烟晶、黄晶、紫晶、茶晶、蔷薇晶等。
雨花石中的水晶，几乎都是被磨圆后沉积于砾石层中的小块玻璃体，多为无色透明水晶，也有茶晶、发晶、鬃晶、紫晶的。
